Probiotiques spécifiques à la souche : choisir une souche documentée

Choisir une souche probiotique est un exercice de diligence raisonnable. Pour un formulateur, les questions qui comptent sont de savoir si la souche est correctement identifiée, si elle est sûre et si elle est validée cliniquement. VF Bioscience développe et caractérise des souches probiotiques, dont Limosilactobacillus fermentum ME-3® et Lactiplantibacillus plantarum VFP46®, et les fournit avec une documentation technique aux fabricants de compléments alimentaires, d’aliments fonctionnels et de produits pharmaceutiques du monde entier.
Pourquoi l’efficacité des probiotiques est-elle spécifique à la souche ?
Les probiotiques sont définis comme des « micro-organismes vivants qui, lorsqu’ils sont administrés en quantités adéquates, confèrent un bénéfice pour la santé de l’hôte » (Hill et al., 2014). Une revue systématique des données a conclu que « des preuves solides ont été trouvées à l’appui de l’hypothèse selon laquelle l’efficacité des probiotiques est à la fois spécifique à la souche et spécifique à la maladie » (McFarland et al., Frontiers in Medicine, 2018). En pratique, cela signifie qu’une propriété démontrée pour une souche ne peut être présumée pour une autre souche de la même espèce, et encore moins du même genre. Deux souches de L. plantarum peuvent se comporter différemment. C’est pourquoi le nom de l’espèce sur une étiquette apprend très peu de choses à un formulateur, alors que la désignation de la souche lui apprend presque tout.
Comment une souche probiotique est-elle identifiée et documentée ?
L’identification se fait au niveau du genre, de l’espèce et de la souche à l’aide de méthodes validées. Le séquençage du génome complet est aujourd’hui la méthode de référence : « la référence absolue pour l’identification des souches est le séquençage du génome complet (WGS), y compris tout élément extrachromosomique » (Binda et al., 2020). Au-delà du séquençage, les lignes directrices de longue date de la FAO/OMS exigent qu’une souche soit nommée conformément au Code international de nomenclature et déposée dans une collection de cultures internationalement reconnue, la désignation du genre, de l’espèce et de la souche figurant sur l’étiquette (FAO/OMS, 2002). Un numéro de dépôt dans une collection reconnue est donc un marqueur élémentaire attestant qu’une souche est réelle, traçable et reproductible.
Qu’est-ce que le statut QPS, et que ne signifie-t-il pas ?
La présomption qualifiée de sécurité (Qualified Presumption of Safety) est la voie simplifiée et générique de l’Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) pour la pré-évaluation de la sécurité des micro-organismes utilisés dans la chaîne alimentaire humaine et animale. Elle est accordée à un niveau taxonomique, l’espèce pour les bactéries, et toute préoccupation de sécurité est exprimée sous forme de « qualifications » rattachées à cette unité. Le statut QPS ne dit rien de l’efficacité ni des allégations de santé autorisées.
Les dénombrements d’UFC garantissent-ils la puissance ?
Non, pour deux raisons. Premièrement, le dénombrement des unités formant colonie (UFC) mesure les cellules viables, c’est-à-dire la viabilité et la quantité, pas l’effet clinique ; l’efficacité est spécifique à la souche et à la dose et doit être démontrée dans des études portant sur cette souche. Deuxièmement, le nombre de cellules viables diminue au cours du stockage, de sorte que le dénombrement doit être garanti jusqu’à la fin de la durée de conservation. Une étiquette devrait indiquer le « nombre minimal de cellules viables de chaque souche probiotique à la fin de la durée de conservation », car un chiffre donné « au moment de la fabrication » est insuffisant si vous achetez le produit peu avant la fin de sa durée de conservation (ISAPP).
Quelles allégations peut-on formuler pour un probiotique dans l’UE ?
Il n’existe aucune allégation de santé autorisée dans l’UE pour les probiotiques, et le terme « probiotique » à lui seul est considéré comme une allégation de santé non autorisée dans de nombreux pays de l’UE. Toutefois, l’application n’est pas uniforme : plusieurs États membres autorisent le terme au moyen d’orientations nationales (FoodNavigator, 2025). La seule allégation autorisée relative aux cultures vivantes concerne les ferments du yaourt et l’amélioration de la digestion du lactose, à raison d’un minimum de 100 millions (10^8) de cellules de ferment vivantes par gramme (Règlement (UE) n° 432/2012), et il s’agit d’une allégation relative aux ferments, pas d’une allégation relative aux probiotiques.
Questions fréquentes
Qu'est-ce qui rend une souche probiotique « spécifique à la souche » ?
Les données montrent que l'efficacité des probiotiques est à la fois spécifique à la souche et spécifique à la maladie, de sorte qu'un résultat démontré pour une souche ne peut pas être extrapolé à d'autres souches de la même espèce ou du même genre. La souche, identifiée au niveau de la souche, est l'unité qui compte, pas le nom de l'espèce.
Qu'est-ce que le statut QPS ?
La présomption qualifiée de sécurité (Qualified Presumption of Safety) est la pré-évaluation générique de sécurité de l'EFSA pour les micro-organismes de la chaîne alimentaire humaine et animale, accordée au niveau taxonomique (généralement l'espèce) avec des qualifications. C'est un instrument de sécurité, pas une approbation d'allégation de santé, et chaque souche a toujours besoin de son propre dossier de données de sécurité.
Pourquoi les UFC doivent-elles être garanties jusqu'à la fin de la durée de conservation ?
Le nombre de cellules viables diminue avec le temps, de sorte qu'un dénombrement garanti uniquement à la fabrication peut être insuffisant au moment de l'achat du produit. Les UFC mesurent en outre la viabilité et la quantité, pas l'efficacité clinique, qui dépend de la souche.
Peut-on qualifier un produit de « probiotique » dans l'UE ?
Au niveau de l'UE, le terme probiotique est traité comme une allégation de santé implicite, et comme aucune allégation de santé relative aux probiotiques n'est autorisée, son usage sur les étiquettes est restreint, même si l'application nationale varie et que plusieurs États membres autorisent le terme. VF Bioscience partage la science des souches à titre d'information technique et recommande de confirmer la formulation selon le marché.
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